Regeneron ISEF 2025 大奖：CBIO033 - miRNA在肺癌检测中的应用

迄今为止，表达水平高度失调的microRNA (miRNA) 一直是疾病特异性生物标志物研究的重点。然而，miRNA 与其靶基因之间复杂的调控机制 [4,6]，以及目前尚无一个普遍认可的框架来设定倍数变化 (FC) 阈值以判断失调，这表明中等失调水平的 miRNA 可能仍包含具有临床价值的信息。因此，本研究验证了“低失调水平的 miRNA 可为肺癌 (LC) 诊断提供有用信息”这一假设。为此，我们构建了一个包含阳性组（LC 存在）和阴性组（LC 缺失）完整 miRNA 谱的数据集。将具有统计学意义的 miRNA FC 值分为三个失调范围，如下所示：高（HD）FC <= 0.5 或 FC >= 2.0，中等（MD）FC 在（0.5,0.9] 或 [1.1,2.0）之间，以及不显著（ND）FC 在（0.9,1.1）之间。使用 miRNA 表达水平作为特征，并在每个分类器中选择最具鉴别力的 50 个特征，构建用于 LC 诊断的随机森林二元分类器，三个 FC 范围各一个，产生以下分类准确率：（HD）高 99%，（MD）低 99%，（ND）92%。此外，基于为 HD 和 MD 类别分类器挑选的 100 个 miRNA 池，使用 K 均值聚类来分析这些 miRNA 的选定序列属性，以了解它们之间的关系。该聚类模型取得了最佳性能（基于惯性拐点），n值为31，表明所选miRNA之间存在跨类别序列相似性以及独特的、新颖的MD聚类。\n（有关引用的参考文献，请参阅研究计划。）